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之江生命科学计算开放平台简介

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1.平台入口

https://cloud.aigene.org.cn

2.平台概述

生命科学计算开放平台是运用人工智能和生信算法,服务于生命科学探索和发现的一体化 SaaS 平台。依托之江实验室智能反应堆搭建可伸缩的高性能计算集群,按照技术体系-研发平台-产品管线的路径,搭建基于 AI 和 CRISPR 的智慧细胞基因编辑、计算、设计验证工作流。利用此平台多人便捷协作、数据高效管理、可追踪和智能洞察,从而极大提升科研效率。

3.平台优势

1)数据精准智能:AI 算法获取优质数据集及实验室超算能力;

2)团队交叉融合:生物科学家与人工智能专家深度合作;

3)平台全方位:数字反应堆计算平台与生物湿实验平台。

4.核心功能介绍

1)项目管理

项目管理为生物实验室科研人员提供数据管理、干实验高通量执行及结果可视化展现、多人协作等信息化功能,并辅助科研人员聚焦科学;科研人员通过使用项目管理模块轻松的上传数据、访问数据、运行工具、查看数据动态和权限分配等;可以插件式接入不同实验的计算工具,并支持多人同时在平台上按需发起计算任务,系统自动完成任务调度,提高计算速度、满足多样化需求;为湿实验提供可靠性数据,辅助湿实验进行,有助于科研人员对基因编辑技术的研究和应用。

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2)计算验证工具

计算验证工具封装了人工智能与生信预测分析算法,用户可在平台高效开展生物干实验,相比传统本地执行程序方式极大降低使用门槛,同时提升了实验过程的多人协作性、可复现性和数据管理效率。目前先期上线了围绕 CRISPR 基因编辑的几个工具,支持 Cas 蛋白酶筛选改良、sgRNA 设计验证等科研活动,另外蛋白质结构预测、结构对齐等工具具有其他更广领域的通用性。如有更多工具需求,欢迎交流合作。

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3)CRISPR 基因编辑知识库

利用业界公开数据集、专业数据库横向合作以及中心本身探索发现,快速累积多维数据,形成围绕 CRISPR/Cas 基因编辑领域的专业知识库,包括 CRISPR 文献库、知识库、CRISPR-Cas 蛋白/基因库(Cas)、微生物宏基因库(Metagenome)、膜蛋白增溶(CrMP-Sol)等。

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